ממשל ארצות הברית הביע צער ודאגה מן התקרית הקטלנית בלב הים בין חיילי צה"ל למשט המחאה לעזה, אך נמנע מלגנות פעילות צה"ל. מוושינגטון נמסר, כי ירצו להבין בדיוק את נסיבות התקרית בלב הים. בהודעה שנמסרה מהבית הלבן נאמר כי הממשל "מצר עמוקות על אובדן החיים ועל הפצועים שנגרמו, ופועל כדי להבין את הנסיבות סביב הטרגדיה הזו". דברי ביל ברטון, דובר הבית.

התקרית עוררה זעם רב בקרב מדינות אירופה. מוקדם יותר קרא האיחוד האירופי לחקירה מיידית בנושא. מזכ"ל האו"ם, באן-קי-מון אמר בצהריים, כי "חשוב שתהיה חקירה מלאה כדי לבחון בדיוק כיצד אירעה שפיכות הדמים הזו", באן אמר  את הדברים במסיבת עיתונאים באוגנדה. "אני מאמין שישראל חייבת לספק הסבר מלא". 

בכל הזירות נאלצת ישראל להתגונן: במדינות אירופה נקראו השגרירים לשיחות הבהרה ולמתן הסברים על מותם של יותר מעשר הפעילים בהשתלטות הקומנדו הימי על ספינות 'שבירת מצור'. שגרירי ישראל בטורקיה, בצרפת, בספרד, באירלנד, ביוון, בשבדיה ובדנמרק זימנו את הנציגים זומנו אל משרדי החוץ השונים כדי לנפק הסברים.

גם ידידותיה של ישראל, ביניהן בריטניה, לא שתקו בנושא, אך אף לא אחת מהן גינתה את הפעולה. שר החוץ הבריטי החדש, ויליאם הייג, קרא לישראל "לפעול בריסון ובהתאם למחויבויות בינלאומיות. חשוב לעמוד על העובדות בנוגע לתקרית הזו, וחשוב לוודא אם נעשה די כדי למנוע מוות ופציעות", אמר הייג בהודעה שפרסם. "האירוע הזה מדגיש את הצורך להסיר את ההגבלות על גישה לעזה בהתאם להחלטה 1860 של מועצת הביטחון", הוסיף השר הבריטי. "הסגר אינו מתקבל על הדעת ואינו יעיל".

צרפת לא נמנעה מלגנות את ישראל, ומבית נשיאה, ניקולא סרקוזי נמסר, כי "הוא מגנה את השימוש הבלתי פרופרציונלי בכוח ושולח את תנחומיו למשפחות של הקורבנות". סרקוזי הגדיר את ההתגוננות של צה"ל כפעולה ישראלית שנשאה תוצאות טראגיות.

שאר מדינות אירופה הביעו אף הן תרעומת כלפי ישראל, וחלקן אף עצרו הליכים משותפים לשתי המדינות בשל התקרית. ארגון זכויות האדם הבינלאומי, אמנסטי אינטרנשיונל, קרא לחקירה דחופה של התקרית הבוקר.